Miguel Angel Álvarez de desarrolloweb.com publicó un articulo sobre mootools, el cual vale la pena leerlo; aquí un fragmento:
Qué es Mootools, un framework Javascript para construir aplicaciones web dinámicas y compatibles con cualquier navegador. Introducción a Mootools.
Después de trabajar durante unos meses con Mootools, ha llegado el momento de escribir algún artículo sobre este interesante sistema. No puedo decir que sea un experto, ni mucho menos, pero creo que podré ayudar a las personas que quieren dar sus primeros pasos usando Mootools en sus páginas web…
Mootools, te puede servir para darle bueno efectos a tus páginas web, yo en lo particular era un seguidor del Flash, para mi era lo máximo, todas aquellas ventajas que como diseñador podría realizar; sinceramente siempre se me hizo dificil aprenderlo, sin embargo, lo aprendí y aún le muevo pero poco, nunca profundice tanto, a pesar que compre libros de ActionScript y Flash; pero desde que conoci las Hojas de Estilo, y descubri como aplicar códigos de JavaScrip, creanme que el Flash ha quedado en el olvido para mis metas de aprendizaje en medios web, las posibilidades que dan las hojas de estilo junto con algunos códigos JavaScript se pueden hacer cosas, que para mi, son mucho mas interesantes, sobre todo ahora que he estado leyendo un poco de SEO (Search Engine Optimization).
No digo que Flash sea malo, tiene su lugar en el mundo web, pero para mi, la prioridad por ahora ha girado en aprender mucho CSS, PHP y JavaScript.
Si quieres aprender mas sobre Mootools, te invito a leer el articulo de Miguel A. Álvarez para adentrarte al mundo del JavaScript, en los motores de Mootools,